沼氣工程是可以與養殖場糞便處理設備結合的一種技術，是一項以開發利用養殖場糞污為對象，以獲取能源和治理環境污染為目的，實現農業生態良性循環的農村能源工程技術。它包括厭氧發酵主體及配套工程技術，主要是通過厭氧發酵及相關處理降低糞水有機質含量，達到或接近排放標準并按設計工藝要求獲取能源——沼氣；沼氣利用產品與設備技術，主要是利用沼氣或直接用于生活用能，或發電、或燒鍋爐、或直接用于生產供暖、或作為化工原料等；沼肥制成液肥和復合肥技術，則主要是通過固液分離，添加必要元素和成分，使沼肥制成液肥或復合肥，供自身使用或銷售。
沼氣工程的關鍵技術是沼氣厭氧發酵技術，包括常規和高效發酵工藝技術，如上流式厭氧污泥床（UASB）、上流式厭氧固體反應器（USR）和全混式厭氧反應器（CSTR）等。
